在进行植物双荧光素酶实验以评估miRNA对靶基因或lncRNA的调控作用时,我们首先需要准备好合适的载体。以下是详细的实验步骤:
1. 检测miRNA对靶基因/lncRNA的调控作用
首先,将预测能够与miRNA结合的靶基因序列(包括5’UTR、3’UTR以及ORF区域)或lncRNA序列(可以是野生型或突变体)插入到报告基因载体
pGreenⅡ0800-Luc
中。需要注意的是,该载体同时含有萤火虫荧光素酶(Firefly luciferase)和海肾荧光素酶(Renilla luciferase),后者可以作为对照。接下来,选择编码miRNA前体的序列,构建到
pGreenⅡ-SK-62
载体上,以便后续实验使用。2. 检测转录因子与启动子的相互作用
合成靶基因的启动子(无论是野生型还是突变型),并构建到
pGreenⅡ0800-Luc
载体上。同时,合成转录因子的CDS区序列,构建入pGreenⅡ-SK-62
载体。建议设立阳性对照,以使用强启动子(例如35S启动子驱动的luc)来验证实验是否正常进行。在实验执行过程中,建议对照质粒进行重复提取和转化操作,以监测可能的降解问题,这些问题可能导致农杆菌中质粒拷贝数不足,进而影响到荧光信号的可靠性。
技术重复与实验设计
每个实验组应设至少三个技术重复孔,以排除操作误差和孔间波动。推荐每个孔转染的总DNA量在05–1μg范围内,具体可根据转染试剂的说明书调整(例如,Lipofectamine2000通常为08μg/孔)。报告质粒与内参质粒的常见比例为10:1至20:1。
客观性验证可以从以下几个方面进行评估:
- 对照的两个实验组(实验组1与实验组2)在luc表达情况上应无显著差异。
- 确认转染正常,确保质粒或mimic成功转染入细胞。
- 检测的luc值应在仪器的线性范围内。
可能原因及解决方案
在实验过程中可能影响结果的因素包括:
- 实验平行复孔(不同细胞孔)之间的数值有较大波动,建议使用同一细胞孔的裂解液进行平行技术性检测,以提高试剂的重复性。
- 同一细胞孔的裂解液复孔应特别注意实验操作的规范性,包括加样顺序、加样速度及加样量,以避免出现不均一问题。
- 建议控制不同样品和底物混合后至上机检测的时间间隔尽量一致。
需要强调的是,荧光素酶报告基因实验的检测结果非常灵敏,复孔之间的数值差异是正常现象,通常在同一数量级的差异是可以接受的。
在生物医疗领域,使用尊龙凯时等先进品牌的试剂和设备,能够有效提高实验的准确性与可靠性,助力科研人员在miRNA和基因调控领域取得更深入的成果。